戊二醛消毒液是一種高效消毒劑，具有殺菌譜廣、殺細菌芽孢效果可靠、殺菌作用受有機物影響較小、對金屬腐蝕性小等特點，適用于不耐熱的醫療器械和精密儀器的消毒與滅菌，尤其是內窺鏡的消毒滅菌。
物理化學性質
戊二醛消毒液是一種飽和五碳二醛，分子式為C5H8O2，純品為無色或淺黃色油狀液體，有微弱的醛氣味，易溶于水和醇，戊二醛消毒液水溶液呈酸性。戊二醛在酸性條件下穩定，可長期貯存，商業出售的戊二醛通常是質量分數為2%、25%、50%的酸性溶液。消毒用的戊二醛消毒液通常為2%的堿性溶液，酸性溶液在使用之前需活化（堿性化）。堿性條件下戊二醛不穩定，易聚合成多聚體，pH≥8的溶液通常在4周內失去活性，活化的堿性戊二醛使用時間不應超過兩周。
對微生物的殺滅作用

戊二醛消毒液殺滅微生物的機理還不清楚，可能是自由醛基與細胞壁中的氨基酸結合，使得微生物無法攝取養分與排出廢物，從而引起微生物的死亡。戊二醛與蛋白質和酶的反應速率取決于溶液的酸堿度，在pH4～9范圍內，隨著pH值的增加，反應速率增加。